盡管農業部對查處轉基因違規商業化的結果還未對外公開，但多種信息表明，農業部方面正在對包括轉基因種子在內的種子質量問題進行嚴格抽查，而存在問題的企業則難以避免處罰。

        經濟觀察網剛剛從農業部種植管理司獲悉，13家種子企業因經營種子質量問題將受到處罰。

        在13家企業中，遼寧鐵旭種業科技有限公司被吊銷種子生產經營許可證、山東洲元種業股份有限公司暫停種子生產經營活動。 北京龍耘種業有限公司經營、北京中農作科技發展有限公司、河北金科種業有限公司、巴彥淖爾市農業科學院農業新技術開發應用中心、張掖市德農種業有限公司、寧夏科豐種子有限公司、寧夏王太科技種業有限公司、寧夏連湖農業發展有限責任公司、寧夏農墾賀蘭山實業有限公司農牧場農業分公司、湖南北大荒種業科技有限責任公司、重慶西農種業有限公司等被限期整改。

        據一位種子專家透露，農業部是從去年底開始，對玉米、水稻主產區種子企業生產經營的雜交玉米、雜交水稻種子質量進行抽查。在歷時半年多的抽查過程中，上述13家企業由于經營種子質量問題未能過關。農業部方面方面要求不合格企業限期進行整改。對整改無效、仍然存在問題的企業，將重新審查其種子生產經營資格。

        前述專家還透露，被查處的種子方面存在的問題是，“玉米種子不合格主要是品種純度差，自交苗偏多，水稻種子不合格主要是，品種純度差，不育株偏多”，“存在質量問題的種子與轉基因基本沒有關聯”。

        6月中旬經濟觀察報曾獨家披露，在對目前國內市場疑似轉基因水稻、玉米品種進行嚴格抽查之后，農業部將在未來兩三個月內，發布查處違規銷售、種植轉基因種子的公告。